MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Taylorella asinigenitalis 14/45 draft genome

Total Repeats: 27846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021033	ATG	2	6	203	208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191088
2	NC_021033	ATT	2	6	253	258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479191088
3	NC_021033	GTT	2	6	260	265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479191088
4	NC_021033	AT	3	6	345	350	50 %	50 %	0 %	0 %	479191088
5	NC_021033	TA	3	6	530	535	50 %	50 %	0 %	0 %	479191088
6	NC_021033	AT	4	8	541	548	50 %	50 %	0 %	0 %	479191088
7	NC_021033	CTTT	2	8	582	589	0 %	75 %	0 %	25 %	479191088
8	NC_021033	ATTCC	2	10	657	666	20 %	40 %	0 %	40 %	479191088
9	NC_021033	GA	3	6	705	710	50 %	0 %	50 %	0 %	479191088
10	NC_021033	GCAG	2	8	712	719	25 %	0 %	50 %	25 %	479191088
11	NC_021033	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479191088
12	NC_021033	AGCA	2	8	801	808	50 %	0 %	25 %	25 %	479191088
13	NC_021033	CTAG	2	8	827	834	25 %	25 %	25 %	25 %	479191088
14	NC_021033	TA	3	6	857	862	50 %	50 %	0 %	0 %	479191088
15	NC_021033	T	6	6	935	940	0 %	100 %	0 %	0 %	479191088
16	NC_021033	TA	3	6	1027	1032	50 %	50 %	0 %	0 %	479191089
17	NC_021033	CTT	2	6	1075	1080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479191089
18	NC_021033	AAAG	2	8	1083	1090	75 %	0 %	25 %	0 %	479191089
19	NC_021033	ATG	2	6	1101	1106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191089
20	NC_021033	AGGA	2	8	1118	1125	50 %	0 %	50 %	0 %	479191089
21	NC_021033	CATA	2	8	1160	1167	50 %	25 %	0 %	25 %	479191089
22	NC_021033	T	7	7	1198	1204	0 %	100 %	0 %	0 %	479191089
23	NC_021033	AAC	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479191089
24	NC_021033	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	479191089
25	NC_021033	GGA	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479191089
26	NC_021033	AATG	2	8	1458	1465	50 %	25 %	25 %	0 %	479191090
27	NC_021033	AGT	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191090
28	NC_021033	T	6	6	1555	1560	0 %	100 %	0 %	0 %	479191090
29	NC_021033	A	6	6	1832	1837	100 %	0 %	0 %	0 %	479191091
30	NC_021033	TTA	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479191091
31	NC_021033	AAG	2	6	1862	1867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479191091
32	NC_021033	AGT	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191091
33	NC_021033	GTA	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191091
34	NC_021033	TCA	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479191091
35	NC_021033	CGT	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479191091
36	NC_021033	CGT	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479191091
37	NC_021033	TAC	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479191091
38	NC_021033	GCT	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479191091
39	NC_021033	TAAT	3	12	2211	2222	50 %	50 %	0 %	0 %	479191091
40	NC_021033	TC	3	6	2224	2229	0 %	50 %	0 %	50 %	479191092
41	NC_021033	TA	3	6	2259	2264	50 %	50 %	0 %	0 %	479191092
42	NC_021033	TC	3	6	2272	2277	0 %	50 %	0 %	50 %	479191092
43	NC_021033	CAA	2	6	2308	2313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479191092
44	NC_021033	CAA	2	6	2364	2369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479191092
45	NC_021033	GGT	2	6	2497	2502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479191092
46	NC_021033	T	8	8	2670	2677	0 %	100 %	0 %	0 %	479191092
47	NC_021033	TA	3	6	2709	2714	50 %	50 %	0 %	0 %	479191092
48	NC_021033	TC	3	6	2724	2729	0 %	50 %	0 %	50 %	479191092
49	NC_021033	TTTA	2	8	2758	2765	25 %	75 %	0 %	0 %	479191092
50	NC_021033	GCA	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479191092
51	NC_021033	ATT	2	6	2804	2809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479191092
52	NC_021033	CTA	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479191092
53	NC_021033	ATC	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479191092
54	NC_021033	CAA	2	6	2991	2996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479191092
55	NC_021033	T	6	6	3019	3024	0 %	100 %	0 %	0 %	479191092
56	NC_021033	AAAT	2	8	3183	3190	75 %	25 %	0 %	0 %	479191093
57	NC_021033	GTATG	2	10	3197	3206	20 %	40 %	40 %	0 %	479191093
58	NC_021033	TAA	3	9	3266	3274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479191093
59	NC_021033	GTA	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191093
60	NC_021033	TCA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479191093
61	NC_021033	TAG	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191093
62	NC_021033	TAAAT	2	10	3411	3420	60 %	40 %	0 %	0 %	479191093
63	NC_021033	AGA	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479191093
64	NC_021033	T	7	7	3450	3456	0 %	100 %	0 %	0 %	479191093
65	NC_021033	AGAC	2	8	3510	3517	50 %	0 %	25 %	25 %	479191093
66	NC_021033	AAAAG	2	10	3635	3644	80 %	0 %	20 %	0 %	479191093
67	NC_021033	AGA	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479191093
68	NC_021033	ATT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479191094
69	NC_021033	AT	3	6	3899	3904	50 %	50 %	0 %	0 %	479191094
70	NC_021033	AAG	2	6	3925	3930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479191094
71	NC_021033	GA	3	6	4125	4130	50 %	0 %	50 %	0 %	479191094
72	NC_021033	TTG	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479191095
73	NC_021033	GA	3	6	4192	4197	50 %	0 %	50 %	0 %	479191095
74	NC_021033	GCA	2	6	4206	4211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479191095
75	NC_021033	TTG	2	6	4217	4222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479191095
76	NC_021033	GAT	2	6	4227	4232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191095
77	NC_021033	GGT	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479191095
78	NC_021033	AT	3	6	4401	4406	50 %	50 %	0 %	0 %	479191095
79	NC_021033	GTT	2	6	4500	4505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479191095
80	NC_021033	AGTT	2	8	4557	4564	25 %	50 %	25 %	0 %	479191095
81	NC_021033	GCTA	2	8	4638	4645	25 %	25 %	25 %	25 %	479191095
82	NC_021033	TGCT	2	8	4808	4815	0 %	50 %	25 %	25 %	479191095
83	NC_021033	ATGC	2	8	4847	4854	25 %	25 %	25 %	25 %	479191095
84	NC_021033	GCA	2	6	4886	4891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479191095
85	NC_021033	T	6	6	4913	4918	0 %	100 %	0 %	0 %	479191095
86	NC_021033	TA	3	6	4948	4953	50 %	50 %	0 %	0 %	479191095
87	NC_021033	AGC	2	6	4977	4982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479191095
88	NC_021033	TAA	2	6	5016	5021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479191095
89	NC_021033	TTGC	2	8	5041	5048	0 %	50 %	25 %	25 %	479191095
90	NC_021033	AGA	2	6	5097	5102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479191095
91	NC_021033	A	6	6	5272	5277	100 %	0 %	0 %	0 %	479191096
92	NC_021033	ATG	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191096
93	NC_021033	GGT	2	6	5350	5355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479191096
94	NC_021033	TCAGAA	2	12	5381	5392	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479191096
95	NC_021033	AAT	2	6	5408	5413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479191096
96	NC_021033	GTG	2	6	5520	5525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479191096
97	NC_021033	GCT	2	6	5682	5687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479191096
98	NC_021033	A	6	6	5737	5742	100 %	0 %	0 %	0 %	479191096
99	NC_021033	CGAT	2	8	5745	5752	25 %	25 %	25 %	25 %	479191096
100	NC_021033	T	6	6	5752	5757	0 %	100 %	0 %	0 %	479191096
101	NC_021033	ATG	3	9	5801	5809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191096
102	NC_021033	AGCT	2	8	5832	5839	25 %	25 %	25 %	25 %	479191096
103	NC_021033	GAAGG	2	10	5945	5954	40 %	0 %	60 %	0 %	479191096
104	NC_021033	AAGG	2	8	5982	5989	50 %	0 %	50 %	0 %	479191096
105	NC_021033	TGT	2	6	6105	6110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479191096
106	NC_021033	GAA	2	6	6149	6154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479191096
107	NC_021033	A	6	6	6164	6169	100 %	0 %	0 %	0 %	479191096
108	NC_021033	CA	3	6	6371	6376	50 %	0 %	0 %	50 %	479191096
109	NC_021033	TGT	2	6	6403	6408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479191096
110	NC_021033	ATC	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479191096
111	NC_021033	TCG	2	6	6442	6447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479191096
112	NC_021033	GAT	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191096
113	NC_021033	T	6	6	6523	6528	0 %	100 %	0 %	0 %	479191096
114	NC_021033	TTG	2	6	6690	6695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479191096
115	NC_021033	TGA	2	6	6760	6765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191096
116	NC_021033	CGT	2	6	6800	6805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479191096
117	NC_021033	AGC	2	6	6810	6815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479191096
118	NC_021033	GGTC	2	8	6847	6854	0 %	25 %	50 %	25 %	479191096
119	NC_021033	GCG	2	6	6859	6864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479191096
120	NC_021033	CTT	2	6	6872	6877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479191096
121	NC_021033	TGG	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479191096
122	NC_021033	GT	3	6	6902	6907	0 %	50 %	50 %	0 %	479191096
123	NC_021033	TC	3	6	6945	6950	0 %	50 %	0 %	50 %	479191096
124	NC_021033	A	6	6	6963	6968	100 %	0 %	0 %	0 %	479191096
125	NC_021033	TAT	2	6	6971	6976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479191096
126	NC_021033	TTTGC	2	10	7048	7057	0 %	60 %	20 %	20 %	479191097
127	NC_021033	ATTG	2	8	7070	7077	25 %	50 %	25 %	0 %	479191097
128	NC_021033	AATC	2	8	7088	7095	50 %	25 %	0 %	25 %	479191097
129	NC_021033	TAT	2	6	7102	7107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479191097
130	NC_021033	CT	3	6	7144	7149	0 %	50 %	0 %	50 %	479191097
131	NC_021033	AG	3	6	7313	7318	50 %	0 %	50 %	0 %	479191097
132	NC_021033	ATG	2	6	7415	7420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191097
133	NC_021033	TAA	2	6	7485	7490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479191097
134	NC_021033	GAA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479191098
135	NC_021033	TAG	2	6	7842	7847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191098
136	NC_021033	GAAG	2	8	7891	7898	50 %	0 %	50 %	0 %	479191098
137	NC_021033	CTA	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479191098
138	NC_021033	AAG	2	6	7908	7913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479191098
139	NC_021033	TTA	2	6	7928	7933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479191098
140	NC_021033	GAT	3	9	7949	7957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191098
141	NC_021033	TCAAA	2	10	7958	7967	60 %	20 %	0 %	20 %	479191098
142	NC_021033	GCT	2	6	7982	7987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479191098
143	NC_021033	GCAA	2	8	8015	8022	50 %	0 %	25 %	25 %	479191098
144	NC_021033	AGT	2	6	8047	8052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191098
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147	NC_021033	GA	3	6	8274	8279	50 %	0 %	50 %	0 %	479191098
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150	NC_021033	AGCT	2	8	8607	8614	25 %	25 %	25 %	25 %	479191099
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153	NC_021033	AAC	2	6	8748	8753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479191099
154	NC_021033	AGT	2	6	8763	8768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191099
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156	NC_021033	TGC	2	6	9000	9005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479191099
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158	NC_021033	ATTT	2	8	9227	9234	25 %	75 %	0 %	0 %	479191099
159	NC_021033	TA	3	6	9326	9331	50 %	50 %	0 %	0 %	479191100
160	NC_021033	AAT	2	6	9406	9411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479191100
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162	NC_021033	AAT	2	6	9463	9468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479191100
163	NC_021033	GAA	2	6	9492	9497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479191100
164	NC_021033	GA	3	6	9632	9637	50 %	0 %	50 %	0 %	479191100
165	NC_021033	TAA	2	6	9645	9650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479191100
166	NC_021033	TGAA	2	8	9692	9699	50 %	25 %	25 %	0 %	479191100
167	NC_021033	CTA	2	6	9720	9725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479191100
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169	NC_021033	TA	4	8	9739	9746	50 %	50 %	0 %	0 %	479191100
170	NC_021033	AATA	2	8	9754	9761	75 %	25 %	0 %	0 %	479191100
171	NC_021033	TAGT	2	8	9786	9793	25 %	50 %	25 %	0 %	479191100
172	NC_021033	TAAA	2	8	9798	9805	75 %	25 %	0 %	0 %	479191100
173	NC_021033	T	7	7	9819	9825	0 %	100 %	0 %	0 %	479191100
174	NC_021033	ATC	2	6	9860	9865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479191100
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176	NC_021033	A	6	6	9941	9946	100 %	0 %	0 %	0 %	479191100
177	NC_021033	TAG	2	6	9972	9977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191100
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253	NC_021033	TATT	2	8	14625	14632	25 %	75 %	0 %	0 %	479191104
254	NC_021033	GCT	2	6	14637	14642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479191104
255	NC_021033	AT	3	6	14681	14686	50 %	50 %	0 %	0 %	479191104
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259	NC_021033	T	6	6	15019	15024	0 %	100 %	0 %	0 %	479191104
260	NC_021033	TTA	2	6	15054	15059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479191104
261	NC_021033	AAT	2	6	15069	15074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479191104
262	NC_021033	CAA	2	6	15125	15130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479191104
263	NC_021033	GGTT	2	8	15145	15152	0 %	50 %	50 %	0 %	479191104
264	NC_021033	ATG	2	6	15202	15207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191104
265	NC_021033	ATT	2	6	15227	15232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479191104
266	NC_021033	TA	3	6	15345	15350	50 %	50 %	0 %	0 %	479191104
267	NC_021033	CAA	2	6	15442	15447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479191104
268	NC_021033	GAT	2	6	15456	15461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191104
269	NC_021033	ATG	2	6	15466	15471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191104
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271	NC_021033	CCG	2	6	15635	15640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479191104
272	NC_021033	CT	3	6	15641	15646	0 %	50 %	0 %	50 %	479191104
273	NC_021033	TTA	2	6	15658	15663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479191104
274	NC_021033	TAT	2	6	15753	15758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479191104
275	NC_021033	ATAC	2	8	15850	15857	50 %	25 %	0 %	25 %	479191104
276	NC_021033	A	6	6	15858	15863	100 %	0 %	0 %	0 %	479191104
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281	NC_021033	A	6	6	16212	16217	100 %	0 %	0 %	0 %	479191104
282	NC_021033	CAA	2	6	16242	16247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479191104
283	NC_021033	TTAA	2	8	16248	16255	50 %	50 %	0 %	0 %	479191104
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288	NC_021033	T	6	6	16543	16548	0 %	100 %	0 %	0 %	479191105
289	NC_021033	AT	3	6	16620	16625	50 %	50 %	0 %	0 %	479191105
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293	NC_021033	TGA	2	6	16819	16824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479191105
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302	NC_021033	TAAA	2	8	17304	17311	75 %	25 %	0 %	0 %	479191105
303	NC_021033	TGCT	2	8	17355	17362	0 %	50 %	25 %	25 %	479191105
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